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【Cloud Edge第9期】初创公司Spiral Genetics:超越现有DNA序列分析平台40倍速

[日期:2013-03-15] 来源:GigaOM  作者:Ki Mae Heussner [字体: ]

摘要:Spiral Genetics是一家数据分析的初创公司,它主要帮助研究人员快速的分析DNA序列数据。该公司声称可以在三个小时之内分析一个完整人类的基因组序列,速度要比其他公司的数据分析平台快40倍。不过令人惊奇还在于,该创业团队阵容非常豪华,而且还有不少“巾帼英雄”。

Spiral Genetics是一家总部位于西雅图的初创公司,它主要帮助研究人员和其他相关人员快速的分析DNA序列数据,近期在A轮融资中获得了300万美元,该轮融资由风险投资公司DFJ引导。在该轮融资之后,Spiral Genetics获得的风投总额为370万美元。

Spiral Genetics的联合创始人兼CEO Adina Mangubat是一位巾帼英雄,她和她的 8人团队准备利用这笔资金来扩展产品的研发,同时也准备拓展新的销售渠道和市场。

管理团队


首席执行官 Adina Mangubat (女)

Adina Mangubat曾经在两个专注于分布式计算领域的高科技初创公司担任过领导职务。而且在这两家公司中,Adina Mangubat都身居要职,她的职责覆盖了团队的开发,执行团队的管理,品牌发展,市场,渠道开发以及技术销售等诸多领域,直接面对消费者的产品。除此之外,她的角色还侧重对消费者的培育。她拥有心理学学士学位,专注于生物心理学,精神药理学和企业管理。

首席科学家 Becky Drees博士(女)

Becky Drees博士是一位多才多艺的分子生物学家,Becky Drees在华盛顿大学研究基因组蛋白-蛋白之间的相互作用网络;在系统生物学研究所从事遗传关系图的研究;还在Fred Hutchinson癌症研究中心为艾滋病病毒研究淋巴细胞的表达构图。她从事的领域涉及高通量筛选技术,基因组注释,基因的表达分析以及新一代测序技术。 她拥有美国德克萨斯州A&M大学生物化学学士学位和美国加州大学伯克利分校的分子生物学博士学位。

首席技术官 Jeremy Bruestle

Jeremy在分布式计算领域拥有深厚的背景。Jeremy拥有5个授权的技术专利,他喜欢把学术研究转化为技术应用,在两者之间架起一座桥梁。近期的项目包括为细胞图像分析和先进的视网膜成像系统构建的一个并行处理引擎,这是一个跟美国印第安纳大学的研究人员共同开发的项目。


 

Mangubat表示,当她和其中的一位联合创始人Becky Drees第一次接触到基因学这个领域时,他们就计划推出类似 23andMe公司为消费者提供基因检测的服务。但是当公司准备发布产品时,他们却选择了另一个不同的发展方向。

Mangubat说:“我们正在这个行业中慢慢摸索,我们也想在基因的计算和分析领域做一点真正有影响力的事情。”他们意识到:在处理基因序列的过程中速度和数量上还存在很大的瓶颈;他们果断的抓住了这一个机会,推出了这个高性能的生物信息分析工具。

虽然目前有很多公司在从事同样的工作,像 DNANexus公司也提供了DNA序列分析,甚至其他公司还进行内部的分析。但是Mangubat指出,他们已经预想了一项服务,可以大大缩短研究人员和其他行业人员在处理海量数据时的周转时间。在上个月,总部位于加利福尼亚州Redwood市的 Bina Technologies公司也宣布推出基因组分析平台的商业版,而且速度上超越了现有的所有平台。

Mangubat和Drees以及该公司的第三位联合创始人Jeremy Bruestle合作,着手构建了这个计算平台,专门为了解决在DNA序列分析过程中的大数据分析问题。Spiral Genetics公司声称,它们可以在三个小时之内分析一个完整人类基因组序列,这个速度要比其他公司的数据分析平台快40倍。

Spiral Genetics的客户群体覆盖了学术研究机构人员,甚至还有一些企业。Mangubat解释说,像一些医学研究人员可能会使用这些生物学信息来解决儿童的癌症问题,而从事农业相关工作的客户可以用来研究不用品系玉米的基因序列。(文/王鹏,审校/仲浩)

原文链接: big-data-bioinformatics-startup-spiral-genetics

 

   
Cloud Edge:2013年国际“云先锋”系列报道 
序号公司名称成立时间CEO/CTO风险投资公司产品/方向
1. HStreaming 2011年 Jana Uhlig $ 1M (B) 实时hadoop系统
2. CitusData 2012年  Matt Ocko   CitusDB
3. Backblaze 2009年 Gleb Budman   开源存储硬件
4. Kickboard 2009年 Jennifer Medberry $2.8M(A) Kickboard(数据分析)
5. Elasticsearch 2012年 Shay Banon $24 M(B) Elasticsearch(开源搜索)
6. Appcore 2008年 Jeff Tegethoff $6M  (B) 企业内部部署IaaS平台
7. Pertino 2011年 Craig Elliott $20 M(B) 软件定义网络(SDN)
 8. SwiftStack  2011年  Joe Arnold $6.1M(A)  软件定义存储
 9. Spiral Genetics  2009年  Adina Mangubat $3M(A) DNA序列数据分析平台
10. DNNResearch 2012年  Geoffrey Hinton   深度学习

 

 





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